Pe măsură ce popularitatea Falun Gong creşte din ce în ce mai mult, apar primele semne de represiune din partea statului. La scurt timp după ce cărţile Falun Gong sunt numite bestseller, publicarea lor este interzisă pe data de 24 iulie, printr-o comandă internă emisă de Biroul Chinei de Editare a Ştirilor. o entitate din cadrul Ministerului de Propagandă. Documentul acuză Falun Gong că "răspândeşte superstiții". La 17 iunie 1996, apare primul articol al unei mari entităţi media a statului chinez, Cotidianul Guangming, care critică Falun Gong.

Biroul nr. 1 al Ministerului Securității Publice emite Documentul nr. 555, intitulat "Notificare privind investigaţia asupra Falun Gong", susținând că Falun Gong este un cult eretic. Ministerul începe o serie de investigații, căutând dovezi în sprijinul concluziei. Mijloacele includ interceptarea liniilor telefonice, monitorizarea voluntarilor, raiduri la domiciliu, confiscarea bunurilor personale. Au loc diferite forme de hărțuire (ilegală) din partea poliției chineze, incluzând întreruperea sesiunilor de exerciţii publice de dimineață cu tunuri de apă și desfiinţarea anumitor locuri de practică. În unele zone casele sunt percheziţionate brutal.

După ce a primit un mare număr de scrisori de îngrijorare, Qiao Shi, care tocmai terminase un mandat de președinte al Comitetului Permanent al Congresului Național al Poporului, fiind membru al Biroului Politic, conduce propria sa investigație asupra acuzațiilor din Documentul 555. La această investigație se alătură și alți membri ai Congresului. După câteva luni de investigare, grupul concluzionează că "Falun Gong aduce sute de beneficii chinezilor şi naţiunii, nefăcând niciun rău".

Comisia Națională pentru Sport a Chinei lansează o anchetă proprie despre Falun Gong. La 20 octombrie, anchetatorul șef declara: "Suntem convinși că exercițiile și efectele Falun Gong sunt excelente. A făcut multe lucruri extraordinare pentru a contribui la stabilitatea și etica societății. Acest lucru ar trebui afirmat în mod corespunzător".

Un studiu realizat de Comisia de Stat a Sportului estimează că peste 70 de milioane de oameni practică Falun Gong în China.

Atacurile asupra Falun Gong se intensifică în mass-media de stat, chiar dacă în paralel continuă și unele rapoarte pozitive, sugerând diviziuni interne în conducerea politică a Chinei. Aderenții Falun Gong răspund criticilor vizitând și, uneori, petiționând în fața redacțiilor unor ziare locale sau în fața sediilor unor posturi de televiziune, cerând o mai mare acuratețe în raportarea informațiilor. Astfel de evenimente au loc la Beijing, Tianjin, Guangzhou și în alte orașe importante.

Un oficial din cadrul Comisiei Naționale pentru Sport a Chinei, vorbind cu revista americană US News & World Report, sugerează că peste 100 de milioane de oameni ar fi început să practice Falun Gong. Oficialul scoate în evidență costurile de care este scutit sistemul național de sănătate din China ca urmare a acestei practici, declarând că "premierul Zhu Rongji este foarte mulțumit de acest lucru".

He Zuoxiu, un proeminent ateu marxist, își exprimă dezaprobarea față de Falun Gong și faţă de Qigong în general într-o revistă de colegiu din Tianjin. Practicanții Falun Gong locali se adună în Tianjin, cerând revistei să repare pagubele aduse reputației practicii.

Deși adunarea este pașnică, pe 23 și 24 aprilie sunt trimise unități de poliție anti-revoltă. 45 de practicanți sunt arestați, unii dintre ei sunt bătuți. Când practicanții cer autorităților din Tianjin să-i elibereze pe cei care au fost arestați, li se spune că ordinul a venit de la Beijing, iar dacă doresc să depună petiţii, trebuie să meargă în capitală.

În ziua următoare, pe 25 aprilie, peste 10.000 de practicanți Falun Gong din Beijing, de pe lângă Tianjin și din alte orașe din zonă, se adună în fața Biroului Consiliului de Stat pentru Petiţii din Beijing. Acest birou este situat chiar lângă Zhongnanhai, complexul rezidențial al liderilor Partidului Comunist. Petiționarii s-au adunat pentru a-şi exprima îngrijorarea cu privire la arestările și abuzurile din Tianjin ce au avut loc cu o zi înainte. Ei solicită eliberarea celor arestați în Tianjin, împreună cu ridicarea interdicției de a tipări cărți Falun Gong și posibilitatea de a practica exercițiile fără ca guvernul să interfereze cu aceasta.

Această adunare a fost, de fapt, una remarcabil de pașnică și ordonată, în ciuda acuzațiilor ulterioare ale Partidului, prin care se declara că Falun Gong "a asediat" Zhongnanhai.

Premierul de atunci al Chinei, Zhu Rongji, se întâlnește cu reprezentanții Falun Gong în biroul său. Până la sfârșitul acelei zile, cei arestați în Tianjin au fost eliberați și adunarea s-a risipit în liniște.

În câteva ore, însă, liderul de atunci al Partidului Comunist Chinez, Jiang Zemin, se opune atitudinii conciliante a lui Zhu și declară că dacă nu poate învinge Falun Gong, Partidul va deveni un "obiect al batjocurii".

Un articol al Associated Press declară că Falun Gong are "mai mulți membri decât Partidul Comunist - cel puțin 70 de milioane, potrivit Administrației de Stat a Sporturilor". În ziua imediat următoare, două articole ale publicației americane, New York Times, au menționat că numărul practicanților Falun Gong a atins cifra de 70 de milioane, atribuind statistica guvernului chinez. Articolul afirmă că "și guvernul Chinei estimează că [Falun Gong] are mai mulți membri decât Partidul Comunist Chinez".

Președintele Jiang Zemin înființează Biroul 610, o agenție de tip Gestapo, creată la nivel național cu scopul de a eradica Falun Gong, având putere absolută asupra Partidului şi guvernului, autoritatea de a emite ordine directe armatei, forţelor de securitate, poliţiei, sistemului judiciar, Ministerului de Propagandă şi puterea de a controla toate resursele şi sistemele guvernului.

Pe data de 20 iulie 1999, Falun Gong este în mod oficial interzis de conducerea comunistă a Chinei.
De la adunarea din 25 aprilie până la jumătatea lunii iulie, practicanţi din toată China raportează că sunt urmăriți de poliţie și interogați, deoarece Partidul întocmeşte liste cu persoanele care practică, și face pregătiri finale pentru interzicerea ulterioară.
Pe data de 20 iulie 1999, poliția din întreaga Chină demarează acțiuni de arestare a practicanților Falun Gong care erau considerați organizatori-cheie și le vandalizează casele. Pe 22 iulie 1999, începe campania media împotriva practicii. Undele radio, ecranele televizoarelor și paginile ziarelor sunt umplute cu informații ostile la adresa Falun Gong. Camionete cu difuzoare sunt puse în mișcare pe străzile orașelor și prin campusurile studențești, avertizând că practicarea Falun Gong este acum ilegală. Printre prevederile interdicției, a protesta împotriva interdicției este, de asemenea, un fapt interzis (link către raport).
Au loc arestări masive și, totodată, răpiri, percheziții brutale și confiscări ale materialelor ce au legătură cu Falun Gong. O campanie de propagandă anti-Falun Gong este lansată simultan la nivel național.